Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ophn1Q99J31 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms