Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn16Q925N4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn16Q925N4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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