Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfdQ925I7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PdgfdQ925I7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PdgfdQ925I7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PdgfdQ925I7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PdgfdQ925I7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfdQ925I7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfdQ925I7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfdQ925I7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfdQ925I7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfdQ925I7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfdQ925I7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfdQ925I7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfdQ925I7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms