Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf144aQ925F3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Rnf144aQ925F3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Rnf144aQ925F3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Rnf144aQ925F3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Rnf144aQ925F3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Rnf144aQ925F3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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