Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim59Q922Y2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms