Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nek8Q91ZR4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nek8Q91ZR4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nek8Q91ZR4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nek8Q91ZR4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nek8Q91ZR4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nek8Q91ZR4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nek8Q91ZR4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nek8Q91ZR4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nek8Q91ZR4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nek8Q91ZR4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nek8Q91ZR4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek8Q91ZR4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms