Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pde6cQ91ZQ1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pde6cQ91ZQ1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms