Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd3Q91WC0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms