Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms