Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms