Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cabp4Q8VHC5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms