Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dkk4Q8VEJ3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms