Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Krt79Q8VED5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Krt79Q8VED5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Krt79Q8VED5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Krt79Q8VED5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Krt79Q8VED5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Krt79Q8VED5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Krt79Q8VED5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Krt79Q8VED5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Krt79Q8VED5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt79Q8VED5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms