Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ttc8Q8VD72 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ttc8Q8VD72 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc8Q8VD72 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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