Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc12Q8R344 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc12Q8R344 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms