Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Hoxc12Q8K5B8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Hoxc12Q8K5B8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Hoxc12Q8K5B8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Hoxc12Q8K5B8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc12Q8K5B8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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