Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nek9Q8K1R7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Nek9Q8K1R7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Nek9Q8K1R7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek9Q8K1R7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms