Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tbc1d23Q8K0F1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms