Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LgsnQ8CIX8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms