Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Clip4Q8CI96 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Clip4Q8CI96 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Clip4Q8CI96 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Clip4Q8CI96 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Clip4Q8CI96 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Clip4Q8CI96 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Clip4Q8CI96 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Clip4Q8CI96 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Clip4Q8CI96 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Clip4Q8CI96 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Clip4Q8CI96 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clip4Q8CI96 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip4Q8CI96 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms