Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim32Q8CH72 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim32Q8CH72 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim32Q8CH72 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim32Q8CH72 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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