Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SltmQ8CH25 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SltmQ8CH25 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms