Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

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Length 1,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rp1l1Q8CGM2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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