Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc17Q8CE13 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc17Q8CE13 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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