Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vcpip1Q8CDG3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms