Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc27Q8CD92 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc27Q8CD92 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc27Q8CD92 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc27Q8CD92 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc27Q8CD92 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc27Q8CD92 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc27Q8CD92 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc27Q8CD92 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc27Q8CD92 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc27Q8CD92 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc27Q8CD92 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc27Q8CD92 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms