Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf2Q8CB19 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms