Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp20Q8C6M1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms