Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubqln3Q8C5U9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubqln3Q8C5U9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubqln3Q8C5U9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubqln3Q8C5U9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubqln3Q8C5U9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubqln3Q8C5U9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubqln3Q8C5U9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubqln3Q8C5U9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubqln3Q8C5U9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubqln3Q8C5U9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubqln3Q8C5U9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ubqln3Q8C5U9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubqln3Q8C5U9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms