Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0X2

Slc9b1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9b1Q8C0X2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc9b1Q8C0X2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc9b1Q8C0X2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc9b1Q8C0X2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc9b1Q8C0X2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc9b1Q8C0X2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc9b1Q8C0X2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc9b1Q8C0X2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc9b1Q8C0X2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Slc9b1Q8C0X2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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