Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpcpd1Q8C0L9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms