Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccser1Q8C0C4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms