Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctdsp2Q8BX07 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms