Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp43Q8BUM9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Usp43Q8BUM9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Usp43Q8BUM9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Usp43Q8BUM9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp43Q8BUM9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp43Q8BUM9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms