Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rab11fip4Q8BQP8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rab11fip4Q8BQP8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rab11fip4Q8BQP8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rab11fip4Q8BQP8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rab11fip4Q8BQP8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rab11fip4Q8BQP8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rab11fip4Q8BQP8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab11fip4Q8BQP8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab11fip4Q8BQP8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab11fip4Q8BQP8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rab11fip4Q8BQP8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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