Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Fbxo38Q8BMI0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Fbxo38Q8BMI0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Fbxo38Q8BMI0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms