Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan12Q8BKT6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms