Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tspan9Q8BJU2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms