Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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