Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms