Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca8Q8BHX3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca8Q8BHX3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms