Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms