Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8BGC1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms