Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34b3Q80ZS5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms