Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SnupnQ80W37 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SnupnQ80W37 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SnupnQ80W37 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SnupnQ80W37 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SnupnQ80W37 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SnupnQ80W37 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SnupnQ80W37 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SnupnQ80W37 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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