Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfap100Q80VN0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms