Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pja2Q80U04 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pja2Q80U04 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms