Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN7

Igsf5, Immunoglobulin superfamily member 5, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf5Q7TSN7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf5Q7TSN7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf5Q7TSN7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf5Q7TSN7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf5Q7TSN7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf5Q7TSN7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms