Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp397Q7TNK4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp397Q7TNK4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms