Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf139Q7TMV1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms